Este río es parte del Refugio de Vida Silvestre Caño Negro – un sitio Ramsar – aquí encontrará uno de los hábitats de flora y fauna más diversos de Costa Rica.

A lo largo del río es posible observar gran cantidad de aves como el pájaro serpiente, garzas, cormoranes y animales como: monos aulladores, arañas o incluso cara blanca, perezosos de tres dedos y algunos reptiles como caimanes, lagartijas y tortugas.